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InGénierie Ecologique d’écosystèmes microbiens
producteurs de bioHydrogène par voie fermentaire

Voici la page d’accueil du projet InGEcoH subventionné par l’ANR, une collaboration entre le Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement (LBE), Narbonne, le Laboratoire de Bioénérgétique et Ingénierie des Protéines (BIP); Marseille, et le Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Toulouse.

Table des matières

Coordinateur du projet

Dr Jean-Phillippe Steyer, Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement, Avenue des Étangs, 11100 Narbonne, France

Tél. + 33 468 425 178 (steyer@supagro.inra.fr)

Partenaires

Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement
(INRA - UR050)

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 [INRA logo]

Adresse : Avenue des Étangs, 11100 Narbonne, France

Contact : Dr Jean-Phillippe Steyer ; tél. + 33 468 425 178 (steyer@supagro.inra.fr)

Équipe : Jérôme Hamelin, Eric Latrille, Marianne Quémeneur, Yan Rafrafi, Eric Trably

Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines
(CNRS – UPR9036)

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 [CNRS logo]

Adresse : 31 chemin Joseph-Aiguier, B.P. 71, 13402 Marseille Cedex 20 France

Contact : Dr Marie-Thérèse Giudici-Orticoni ; tél.+ 33 491 16 45 50 (giudici@ifr88.cnrs-mrs.fr)

Équipe : Saida Benomar, María Luz Cárdenas, Athel Cornish-Bowden, Marianne Guiral, Marianne Ilbert, Gisèle Leroy

Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés
(UMR INSA/CNRS 5504, UMR INSA/INRA 792)

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 [CNRS logo]
 [INRA logo]

Adresse : 135 avenue de Rangueil, 31077 Toulouse France

Contact : Dr Isabelle Meynial-Salles ; tél.+ 33 561 55 94 19 (meynial@insa-toulouse.fr)

Équipe : Christian Croux, Philippe Soucaille

Personnel

Photographie du personnel Jérôme Jean-Phi Eric L. Athel Yan Eric T. Marianne I. Mariam Marilú Gisèle Marianne G.; Mariianne Q. Saida Isabelle Marie-Thé

La photographie a été prise à Narbonne en janvier 2009. Christian Croix n'est pas présent sur la photo. Jérôme Hamelin est montré comme vignette.


Résumé

Un grand nombre d’espèces microbiennes sont présentes dans des environnements divers et présentent une large gamme de métabolismes pouvant produire de l’hydrogène par voie fermentaire. Même si les productivités et les rendements en biohydrogène peuvent être intéressants, de nombreux verrous scientifiques restent à être levés, et notamment les problèmes d’instabilité chronique des procédés liés à la présence de métabolismes dérivés de consommation en hydrogène. Dans le cadre d’une production continue et durable, la levée de ces verrous nécessite une meilleure compréhension des interactions métaboliques existant entre microorganismes producteurs et consommateurs d’hydrogène au sein de ces cultures mixtes. Le projet InGEcoH propose de développer une approche innovante et pluridisciplinaire d’ingénierie écologique qui consiste en la conception, la construction et l’étude de consortiums microbiens afin d’établir les paramètres régissant les réseaux d’interactions métaboliques avec pour objectif d’optimiser la production d’hydrogène. Plus précisément, il s'agira

  1. de sélectionner et caractériser des bactéries à haut potentiel de production d’hydrogène pour une large gamme de substrats,
  2. de construire un consortium microbien synthétique pour l’élaboration de modèles mécanistiques de réseaux d’interactions métaboliques, et
  3. d’en étudier et d’en optimiser les performances sous conditions réelles en comparaison avec des écosystèmes plus complexes.

Financement

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Projet ANR-08-BIOE-005 commencé en décembre 2008 pour une durée de 36 mois ; aide de l’ANR de 706380€.

Contact

Voici une liste des adresses électroniques des participants :

Mariam Benjdiamariam.benjdia@agencerecherche.fr
Saida Benomarsbenomar@ifr88.cnrs-mrs.fr
María Luz Cárdenascardenas@ifr88.cnrs-mrs.fr
Athel Cornish-Bowdenacornish@ifr88.cnrs-mrs.fr
Christian Crouxchristian.croux@insa-toulouse.fr
Marie-Thérèse Giudici-Orticonigiudici@ifr88.cnrs-mrs.fr
Marianne Guiralguiral@ifr88.cnrs-mrs.fr
Jérôme Hamelinhamelin@supagro.inra.fr
Marianne Ilbertmilbert@ifr88.cnrs-mrs.fr
Eric Latrillelatrille@supagro.inra.fr
Gisèle Leroyleroy@ifr88.cnrs-mrs.fr
Isabelle Meynial-Sallesisabelle.meynial-salles@insa-toulouse.fr
Marianne Quémeneurmarianne.quemeneur@supagro.inra.fr
Yan Rafrafirafrafi@supagro.inra.fr
Jean-Philippe Steyersteyer@supagro.inra.fr
Eric Trablytrably@supagro.inra.fr
Senthil Kumar Velusamysenthilk@insa-toulouse.fr

Événements

1 décembre 2008. Commencement officiel du projet.

8 janvier 2009. Date prévue pour la prémière réunion à Narbonne : rapportée par raison de forte neige à Marseille !

21 janvier 2009. Prémière réunion à Narbonne. Présents : Mariam Benjdia, Saida Benomar, María Luz Cárdenas, Athel Cornish-Bowden, Marie-Thérèse Giudici-Orticoni, Marianne Guiral, Jérôme Hamelin, Marianne Ilbert, Eric Latrille, Gisèle Leroy Isabelle Meynial-Salles, Marianne Quémeneur, Yan Rafrafi, Jean-Phillippe Steyer, Eric Trably.

22 avril 2009. Réunion technique (BIP, LBE) à Marseille concernant l'analyse moléculaire de suivi des consortia.

1 juillet 2009. Réunion à Marseille pour présentation aux partenaires du projet des résultats du premier semestre du projet et de l’avancée des différentes tâches. Présents (dans l'ordre de la photographie ci-dessous, de gauche à droite), plus Gisèle Leroy, qui n'est pas dans la photographie) : Marie-Thérèse Giudici-Orticoni, Eric Latrille, Marianne Quémeneur, Jean-Phillippe Steyer, Eric Trably, Marianne Guiral, Isabelle Meynial-Salles, María Luz Cárdenas, Saida Benomar, Jérôme Hamelin, Yan Rafrafi, Marianne Ilbert, Athel Cornish-Bowden.

Après la présentation de quelques points administratifs par Eric Trably, on a discuté en détail les rapports suivants :

Yan Marianne Q.
Saida Athel
  1. Présentation des résultats de thèse de Yan Rafrafi ;
  2. Présentation des travaux de Marianne Quémeneur ;
  3. Présentation des résultats de thèse de Saida Benomar ;
  4. Présentation d'un exemple de modélisation cinétique par Athel Cornish-Bowden.

Photographie du personnel à Marseille

26 janvier 2010. Réunion à Toulouse pour présentation aux partenaires du projet des résultats du deuxième semestre du projet et de l’avancée des différentes tâches. Présents (dans l'ordre de la photographie ci-dessous, de gauche à droite) : Jean-Phillippe Steyer, Senthil Kumar Velusamy, Isabelle Meynial-Salles, Marianne Quémeneur, Eric Latrille, Yan Rafrafi, María Luz Cárdenas, Athel Cornish-Bowden, Jérôme Hamelin, Eric Trably

Marie-Thérèse Giudici-Orticoni et Saida Benomar ont participé aux discussions par téléphone de Marseille. Christian Croux and Philippe Soucaille étaient présents à la réunion mais ils ne s

There was detailed discussion as follows:

  1. Détails administratives (Eric Trably)
  2. Tâche 1: présentation de Senthil Kumar Velusamy par Isabelle Meynial-Salles, suivie par une discussion de ses résultats
  3. Tâche 1: présentation des résultats de Saida Benomar (by telephone)
  4. Tâche 2: présentation des résultats de Yan Rafrafi
  5. Tâche 2/3: présentation résultats de Marianne Quémeneur
  6. Tâche 4: présentation résultats de modélisation (María Luz Cárdenas et Athel Cornish-Bowden)
  7. Dscussion générale, conclusions

Photographie du personnel à Toulouse

4 mars 2010. Réunion technique (BIP, LBE) à Marseille concernant l'analyse moléculaire de suivi des consortia.

18 mai 2010. Comité de thèse (LISBP, BIP, LBE) à Narbonne de Yan Rafrafi.

Le logo du projet

InGEcoH logo C. acetobutylicum D. vulgaris

Le logo a été conçu et réalisé par Giselle Leroy (BIP). Il symbolise les deux espèces de bactéries qui vont être utiliséees dans le projet : Clostridium acetobutylicum à gauche, et Desulfovibrio vulgaris à droite.